Jonas Oliveira

In this work, the stability of the homotrimeric peptide T3-785, a representative model of human collagen, was described in energetic terms using the molecular fractionation with conjugated caps (MFCC) technique and within the scope of density functional theory (DFT). It was possible to predict the individual relevance of the amino acids Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu and Ala, the consequent importance of the triads Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly and Leu-Ala-Gly, and finally the influence of the N-terminal, Central and C-terminal zones of each chain in maintaining the integrity of the collagen triple helix. To make this possible, the forces of attraction and repulsion of the 90 residues that make up the system were calculated. Each of these residues had an interaction energy that varied depending on the chemical nature of its side chain, the microsolvation environment surrounding it and the intermolecular contacts it established. The pioneering study of the conformational stability in energetic terms of a free region of imino acids will encourage research focused on the development and synthesis of high-stability artificial collagens by Bioengineering.

In questo lavoro, la stabilit del peptide omotrimerico T3-785, un modello rappresentativo del collagene umano, stata descritta in termini energetici utilizzando la tecnica del frazionamento molecolare con tappi coniugati (MFCC) e nell'ambito della teoria funzionale della densit (DFT). stato possibile prevedere la rilevanza individuale degli aminoacidi Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu e Ala, la conseguente importanza delle triadi Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly e Leu-Ala-Gly, e infine l'influenza delle zone N-terminale, Centrale e C-terminale di ciascuna catena nel mantenimento dell'integrit della tripla elica del collagene. Per fare ci , sono state calcolate le forze di attrazione e repulsione dei 90 residui che compongono il sistema. Ciascuno di questi residui ha un'energia di interazione che varia a seconda della natura chimica della sua catena laterale, dell'ambiente di microsolvatazione che lo circonda e dei contatti intermolecolari che stabilisce. Lo studio pionieristico della stabilit conformazionale in termini energetici di una regione libera di iminoacidi incoragger la ricerca incentrata sullo sviluppo e la sintesi di collageni artificiali ad alta stabilit mediante la bioingegneria.

Dans ce travail, la stabilit du peptide homotrim rique T3-785, un mod le repr sentatif du collag ne humain, a t d crite en termes nerg tiques l'aide de la technique de fractionnement mol culaire avec capuchons conjugu s (MFCC) et dans le cadre de la th orie de la fonctionnelle de la densit (DFT). Il a t possible de pr dire l'importance individuelle des acides amin s Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu et Ala, l'importance cons quente des triades Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly et Leu-Ala-Gly, et enfin l'influence des zones N-terminale, Centrale et C-terminale de chaque cha ne dans le maintien de l'int grit de la triple h lice du collag ne. Pour ce faire, les forces d'attraction et de r pulsion des 90 r sidus qui composent le syst me ont t calcul es. Chacun de ces r sidus poss de une nergie d'interaction qui varie en fonction de la nature chimique de sa cha ne lat rale, de l'environnement de microsolvatation qui l'entoure et des contacts intermol culaires qu'il tablit. L' tude pionni re de la stabilit conformationnelle en termes nerg tiques d'une r gion libre d'acides iminiques encouragera la recherche ax e sur le d veloppement et la synth se de collag nes artificiels haute stabilit par bio-ing nierie.

In dieser Arbeit wurde die Stabilit t des homotrimeren Peptids T3-785, eines repr sentativen Modells des menschlichen Kollagens, mit Hilfe der Technik der molekularen Fraktionierung mit konjugierten Kappen (MFCC) und im Rahmen der Dichtefunktionaltheorie (DFT) energetisch beschrieben. Es war m glich, die individuelle Bedeutung der Aminos uren Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu und Ala, die daraus folgende Bedeutung der Triaden Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly und Leu-Ala-Gly und schlie lich den Einfluss der N-terminalen, zentralen und C-terminalen Zonen jeder Kette auf die Aufrechterhaltung der Integrit t der Kollagen-Dreifachhelix vorherzusagen. Um dies zu erm glichen, wurden die Anziehungs- und Absto ungskr fte der 90 Reste, aus denen das System besteht, berechnet. Jeder dieser Reste hatte eine Wechselwirkungsenergie, die je nach der chemischen Beschaffenheit seiner Seitenkette, der ihn umgebenden Mikrosolvatationsumgebung und den von ihm hergestellten intermolekularen Kontakten variierte. Die bahnbrechende Studie ber die Konformationsstabilit t einer freien Region von Iminos uren in energetischer Hinsicht wird die Forschung zur Entwicklung und Synthese k nstlicher Kollagene mit hoher Stabilit t durch Bioengineering f rdern.

A infec o reemergente pelo Zika v rus (ZIKV) se tornou uma amea a sa de global devido associa o com anormalidades neurol gicas graves, sendo elas a s ndrome de Guillain-Barr (SGB) em adultos e a s ndrome cong nita do Zika v rus (SCZ) em neonatos. Muitas pesquisas de desenvolvimento e inova o objetivam um composto antiviral eficaz contra o ZIKV, mas at o momento, n o h nenhum composto comercialmente dispon vel. Com o objetivo de elucidar os avan os sobre a infec o pelo ZIKV, esta revis o enfatiza os estudos realizados ap s o surto ocorrido no Brasil entre 2015 e 2016, descrevendo o que h de mais novo sobre a epidemiologia, transmiss o, replica o viral, sintomatologia cl nica, diagn stico laboratorial e radiol gico, tratamento, preven o e alvos de medicamento antiviral para o desenvolvimento de f rmacos anti-Zika.

Nessa obra, a estabilidade do pept deo homotrim rico T3-785, um modelo representativo do col geno humano, foi descrita em termos energ ticos a partir da t cnica de fracionamento molecular com capuzes conjugados (MFCC) e no escopo da teoria do funcional da densidade (DFT). Foi poss vel predizer a relev ncia individual dos amino cidos Pro, Hyp, Gly, Ile, Thr, Gly, Ala, Arg, Gly, Leu e Ala, a consequente import ncia das tr ades Pro-Hyp-Gly, Ile-Thr-Gly, Ala-Arg-Gly e Leu-Ala-Gly, e, por fim, a influ ncia das zonas N-terminal, Central e C-terminal de cada cadeia para a manuten o da integridade da tripla-h lice do col geno. Para isso ser poss vel, as for as de atra o e repuls o dos 90 res duos que comp em o sistema foram calculadas. Cada um desses res duos apresentou uma energia de intera o que variou dependendo da natureza qu mica da sua cadeia lateral, do ambiente de microsolvata o que o envolve e dos contatos intermoleculares que estabelece. O estudo pioneiro da estabilidade conformacional em termos energ ticos de uma regi o livre de imino cidos incitar pesquisas centradas no desenvolvimento e s ntese de col genos artificiais de alta estabilidade pela Bioengenharia.